盐酸西环素胶囊的常见副作用包括恶心、呕吐、腹泻、食欲减退、头痛、头晕、皮疹、过敏反应等。较少见的副作用有光敏感、真菌感染、肝功能异常、胆汁淤积性黄疸等。极少数病例可能出现严重的肝脏损伤、胆汁淤积性胆管炎、胰腺炎、溶血性贫血等严重副作用。在服用盐酸西环素期间，如出现严重副作用或过敏反应，应立即停药并就医。患有肝脏疾病、肾脏疾病、系统性红斑狼疮等慢性疾病的患者在使用前应咨询医生。