在遇到“同时和两个人发生关系怀孕了是谁的”这种问题时，最准确的判断方法是通过DNA鉴定。因为女性怀孕后的胎儿基因是由精子和卵子结合产生的，因此父亲的身份需要通过亲子鉴定来确认。

怀孕后的准确父亲身份只能通过医学手段确定。如果女性在同一时段内与两个人发生了性关系，且其中一个或两个可能是父亲，那么进行DNA鉴定是最科学、最有效的方式。通常通过产前亲子鉴定，可以在怀孕期间通过采集母体血液中的胎儿DNA来进行检测，确认父亲身份。

通过DNA鉴定是确认父亲身份的唯一可靠途径，而怀孕的同时与两个人发生性关系，最终能确定谁是父亲，需要依靠科学的检测方法。