如果婚内女方出轨并怀了别人的孩子，处理这一问题需要考虑以下几个方面：

1. 冷静面对，理清情感与法律问题 保持冷静，不要做出冲动的决定。可以先与配偶坦诚沟通，了解事情的经过和双方的情感状态。此时需要理清情感问题和法律问题的界限。

2. 法律角度的处理 如果确认为婚内出轨且怀孕，男方可以根据法律维护自己的权益。根据中国婚姻法，女方出轨可能构成过错方，在离婚时，过错方可能会在财产分割、抚养权等方面处于不利位置。如果男方选择离婚，可以要求赔偿精神损失费。

3. 孩子的抚养与父亲身份问题 如果孩子是女方与他人所生，男方无义务抚养。但如果男方愿意承担孩子的抚养责任，可以依法申请抚养权。若男方怀疑孩子不是自己的，也可以通过亲子鉴定来确认亲子关系。

4. 双方协商 如果不想离婚，也可以通过婚姻咨询或心理辅导来修复夫妻关系。双方坦诚沟通，寻求专业帮助可能有助于恢复信任与和解。

最终，如何处理婚姻关系，需要考虑情感、法律和双方的意愿。