男性生殖器流脓可能是由于多种原因引起的，包括但不限于性传播感染（STI）如淋病、非淋菌性尿道炎等，以及其他感染性疾病如泌尿系统感染或前列腺炎等。流脓可能是由于感染引起的炎症反应导致的。确切的诊断需要通过医学检查，包括生理检查、实验室检查和医学影像学等方法。如果出现生殖器流脓的症状，建议及时就医，由医疗专业人员进行诊断和治疗。及时治疗是预防并发症和传播的关键。