男孩生殖器上长小泡泡可能是由多种原因引起的。其中一种可能性是毛囊炎，这是一种毛囊感染，常见于生殖器周围。另一种可能性是尖锐湿疣，这是一种通过性接触传播的病毒性感染，通常表现为生殖器上的小而柔软的突起。其他可能的原因还包括湿疹、疱疹等皮肤问题，或是其他感染性疾病。如果出现此类症状，建议尽快就医，由专业医生进行诊断和治疗。不建议自行处理或使用非专业的药物，以免造成更严重的后果。及时就医能够更好地处理并解决问题，确保男孩的健康。