阴茎短小可能的原因有多种，常见的包括以下几点：

1. 遗传因素： 阴茎大小受遗传影响，有时可能与家族中其他男性的阴茎大小有关。

2. 胎儿发育问题： 胎儿期间的发育异常可能导致阴茎发育不良。

3. 荷尔蒙水平： 荷尔蒙在青春期对生殖器官的发育有重要影响，荷尔蒙分泌异常可能影响阴茎的大小。

4. 神经系统问题： 神经系统异常可能会影响阴茎的发育。

5. 慢性疾病： 一些慢性疾病如糖尿病、肾脏疾病等，可能导致阴茎的发育受到影响。

6. 手术或创伤： 阴茎手术或外伤可能会影响阴茎的大小。

7. 心理因素： 心理压力、焦虑等情绪问题有时会影响血液流向阴茎的方式，从而影响其大小。

阴茎短小的原因复杂多样，可能涉及遗传、发育过程中的问题、荷尔蒙水平、神经系统、慢性疾病以及心理因素等多个方面。治疗方法应根据具体情况而定，建议寻求专业医生的帮助进行详细的评估和治疗方案制定。