金刚藤丸可能引起的副作用包括头痛、恶心、腹泻、消化不良和皮疹。部分人可能出现过敏反应，表现为呼吸困难、喉咙紧缩或皮肤发红。长期使用金刚藤丸可能对肝脏造成损害，包括肝功能异常和肝损伤。由于金刚藤丸可能影响荷尔蒙水平，因此可能会影响生育能力。任何不明原因的不适应该立即停止使用金刚藤丸并就医咨询。使用金刚藤丸前，特别是患有慢性疾病或正在服用其他药物的人群，应该咨询医生以避免可能的不良反应。