男人小便疼尿不干净可能由多种原因引起，需要根据具体症状和病史进行详细的评估。以下是几种常见原因及其简要说明：

1. 尿路感染：这是最常见的原因之一。尿路感染通常伴随有尿频、尿急和尿痛等症状，可能由细菌感染引起，需要通过尿液检查确诊并使用抗生素治疗。

2. 前列腺炎：急性或慢性前列腺炎会导致尿痛和排尿不适。急性前列腺炎可能还会出现发热、寒战等症状。前列腺炎通常需要抗生素治疗，有时还需服用止痛药和抗炎药。

3. 性传播疾病：如淋病或衣原体感染等性传播疾病也可能导致尿痛和排尿不适。这类感染通常伴随有尿道分泌物，需要通过实验室检测确诊，并根据病原体选择适当的抗生素治疗。

4. 尿道结石：小的尿道结石可能会引起排尿疼痛和尿流中断。结石通过尿液检查或影像学检查可以发现，治疗方式包括增加液体摄入、使用药物或进行外科干预。

5. 膀胱炎：膀胱炎是膀胱的感染或炎症，也会导致尿痛和排尿困难。与尿路感染类似，需要抗生素治疗。

若出现小便疼痛和尿不干净的症状，建议尽快就医进行详细检查和诊断，以便确定具体原因并及时治疗。避免自行服药或拖延就医，以防病情加重。