生殖器疱疹的治疗主要依赖抗病毒药物，常用的药物包括阿昔洛韦（Acyclovir）、磷酸阿昔洛韦（Valacyclovir）、和法沙韦（Famciclovir）。这些药物可以有效抑制病毒复制和减轻症状。通常，医生会根据病情严重程度和个体情况来决定使用哪种药物、剂量以及治疗时长。早期使用抗病毒药物有助于缩短疱疹病程和减轻症状。

对于一些严重或反复发作的生殖器疱疹病例，医生可能会考虑长期的抗病毒药物预防治疗，以减少疱疹的复发率和减轻症状的严重程度。需要注意的是，药物治疗应在专业医生的指导下进行，遵循医嘱使用药物，不要自行更改剂量或停药，以免影响治疗效果或产生不良反应。