复方消化酶胶囊可能会引起一些副作用，这些副作用通常是轻微且暂时的。常见的副作用包括：腹部不适、恶心、腹泻或便秘。个别人群可能还会出现过敏反应，如皮疹、瘙痒、面部肿胀或呼吸困难。长期或高剂量使用可能导致胰腺功能受损。

需要注意的是，不同品牌的复方消化酶胶囊成分可能有所不同，因此副作用也可能略有差异。在使用前，建议咨询医生或药剂师，了解详细的用药说明和注意事项。如果出现严重的副作用或过敏反应，应立即停止使用并就医求助。