男性生殖器在勃起时通常不应该感到疼痛。正常情况下，勃起是一种生理反应，是由血液充盈阴茎海绵体组织引起的。如果在勃起过程中感到疼痛，可能是由于以下原因之一：

1. 阴茎勃起时的拉伤或损伤。
2. 阴茎周围的组织炎症，如龟头炎或包皮炎。
3. 阴茎或尿道感染，例如尿道炎或性传播感染。
4. 阴茎的异常曲率，可能是由于勃起功能障碍引起的。
5. 阴茎或阴囊的其他疾病，如睾丸扭转或淋巴结炎。

如果男性在勃起时感到持续的疼痛或不适，建议尽快就医进行评估和治疗，以排除潜在的严重问题，并获得适当的医疗建议。