男人茎部短的原因可以从多方面分析，主要包括遗传因素、激素水平、健康状况和生活习惯等。

遗传因素在很大程度上决定了个体的生理特征，包括生殖器的长度。父母的基因组合会影响到下一代的身体发育和形态。

激素水平，尤其是睾酮的分泌，对生殖器的发育有重要影响。如果在青春期睾酮水平偏低，可能导致生殖器发育不完全。内分泌系统的紊乱，如垂体或甲状腺功能异常，也可能影响睾酮的正常分泌。

一些健康状况和疾病也可能导致生殖器短小。例如，患有某些先天性疾病（如克氏综合征、Turner综合征）或慢性病（如糖尿病、肥胖症），可能会影响身体的正常发育和功能。

生活习惯和环境因素同样不可忽视。不健康的生活方式，如吸烟、酗酒、缺乏运动等，可能影响整体健康和睾酮水平。长期处于高压力环境或遭受心理创伤，也可能对性发育产生负面影响。

男人茎部短的成因是多方面的，可能是多种因素综合作用的结果。如果对此存在疑虑，建议咨询专业医生进行详细检查和评估。