男性检查衣原体感染的方法包括以下几个步骤：

1. 就医：男性应咨询医生并进行身体检查。医生会询问病史并进行相关检查。

2. 尿液检测：常见的检测方法是利用尿液样本进行衣原体检测。这种方法简便易行且准确度高。

3. 尿道拭子检查：在医生的指导下，通过取样尿道拭子进行检查。这种方法能够更准确地确定衣原体感染。

4. 血液检测：有时医生可能会建议进行血液检测，尤其是对于患有特定症状或并发症的患者。

5. 其他检测：根据具体情况，医生还可能进行其他检测，如病理检查或影像学检查，以确定感染情况和可能的并发症。

男性检查衣原体感染主要通过尿液检测、尿道拭子检查和血液检测等方式进行，具体检测方法需在医生指导下进行。