龟头上起小痘痘可能是由多种原因引起的，包括但不限于以下几种可能性：

1. 小疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的常见皮肤病变，表现为皮肤表面的小颗粒状病变。
2. 滴虫感染：由滴虫引起的性传播感染可能导致龟头上出现小痘痘状的病变。
3. 毛囊炎：龟头周围的毛囊感染引起的炎症，可能表现为小痘痘或红肿。
4. 阴茎疱疹：由单纯疱疹病毒引起的性传播疾病，可能导致龟头上的水疱、疱疹或溃疡。

但需要强调的是，以上列举的可能性仅供参考，具体诊断仍需要就诊医生进行详细的体格检查和实验室检查，以明确病因并制定合适的治疗方案。因此，若发现龟头上出现小痘痘，建议及时就医，避免延误诊断和治疗。