男性生殖器旁边长疙瘩可能由多种原因引起。常见原因包括：

1. 毛囊炎：毛囊感染引起的红肿疙瘩，常伴有疼痛和瘙痒。
2. 疱疹病毒感染：由单纯疱疹病毒引起的水泡样疙瘩，通常伴随疼痛和瘙痒。
3. 尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）引起的疣状增生，表现为无痛的突起物。
4. 脂肪瘤或皮脂腺囊肿：皮下组织内的无痛肿块，通常柔软且可移动。
5. 性病疣：由梅毒、淋病等性传播疾病引起的疙瘩，伴随其他症状如溃疡和分泌物。

如果疙瘩伴随疼痛、溃疡、分泌物或其他症状，建议立即就医。医生可能会通过体检、病史询问及实验室检查（如血液检查、病理检测）来确定病因。对于不同的病因，治疗方法也不同。例如，毛囊炎通常通过抗生素治疗；疱疹和尖锐湿疣则需要抗病毒药物或局部治疗；脂肪瘤和皮脂腺囊肿可能需要手术切除。

男性生殖器旁边长疙瘩的具体原因和治疗方法应由专业医生根据详细的检查结果来确定。自行诊断和治疗可能会延误正确的诊疗，导致病情恶化。