发烧肛门用药可能会有副作用。根据医学研究和临床实践，许多肛门用药都可能引发不同程度的副作用。这些副作用可能包括局部过敏反应，如皮肤瘙痒、红肿、烧灼感等，也可能出现更严重的情况，如皮炎、溃疡等。

有些肛门用药可能含有一些药物成分，长期使用或过量使用可能会导致更严重的副作用，如皮肤萎缩、色素沉着等。因此，在使用肛门用药时，建议遵循医生或药师的建议，严格按照说明书或专业指导使用药物，避免自行增减剂量或长期使用。

对于有潜在过敏史或其他药物敏感性的个体，应特别谨慎选择肛门用药，避免引发过敏反应或其他不良反应。在使用任何药物时，都应保持谨慎，监测可能出现的副作用，并在需要时及时就医或咨询专业医务人员的意见。