酪酸梭菌活菌胶囊在一些人群中可能出现副作用。根据临床研究，常见的副作用包括但不限于腹泻、腹胀、腹痛等消化道不适症状。个别情况下，可能出现过敏反应，如皮疹、瘙痒、呼吸困难等。对于孕妇、哺乳期妇女和免疫功能低下的人群，使用酪酸梭菌活菌胶囊前应咨询医生。与其他药物同时使用时可能产生相互作用，应避免与抗生素等药物同时使用，以免影响疗效。在使用酪酸梭菌活菌胶囊时，严格按照医生或产品说明书的建议使用，避免超量使用或长期连续使用，以减少可能的不良反应发生。