吃黄连上清丸可能引起一些副作用。其中包括但不限于消化不良、恶心、呕吐、腹泻等消化系统反应。个别人群可能出现过敏反应，表现为皮疹、瘙痒、荨麻疹等症状。长期大剂量使用可能会影响肝功能。黄连上清丸主要成分为黄连和黄芩等中药材，对这些成分过敏者应避免使用。在服用黄连上清丸期间，如出现严重不良反应或持续不适，应及时就医。建议在使用前咨询医生，尤其是对于有慢性疾病或正在服用其他药物的人群。