男科疾病中最难治疗的可能是一些慢性疾病，如慢性前列腺炎、阳痿等。这些疾病通常受多种因素影响，治疗过程较为复杂。由于患者的个体差异以及病因不明确，治疗效果可能因人而异。在这些情况下，医生可能需要采取综合治疗方案，包括药物治疗、物理治疗、心理辅导等多种手段相结合，而且治疗过程可能需要较长的时间。一些疾病可能会存在复发的情况，需要长期监测和管理。因此，慢性男科疾病的治疗过程可能会比较棘手，需要患者和医生共同努力，通过持续的治疗和管理来控制病情。