对于男性生殖器根部两侧的胀痛，可能是由多种因素引起的。常见原因包括：睾丸炎、精索静脉曲张、阴囊肿块或疝等。建议立即就医，进行全面的身体检查和必要的检测，以明确诊断。医生可能会进行体格检查、超声波检查等。治疗方法取决于具体的诊断结果，可能包括药物治疗、手术治疗或其他疗法。避免过度运动和受伤，保持适当的休息，穿着透气的内裤，保持良好的个人卫生也是重要的。如果疼痛严重或伴有其他症状，如发热、排尿困难等，应及时就医，以免延误诊断和治疗。