出现在男性生殖器上的小痘痘可能是多种原因导致的，包括但不限于以下几种可能性：

1. 毛囊炎：由于毛囊感染引起的炎症，通常表现为红色、疼痛的小疙瘩。
2. 油脂粒：在毛囊口堵塞的情况下，油脂堆积形成的小颗粒。
3. 性病：如生殖器疱疹、性病淋病等，会在生殖器周围出现痘痘样的疹子。
4. 小疣：由人乳头瘤病毒（HPV）引起的性病，常表现为生殖器上的小疣状病变。

建议及时就医，由专业医生进行详细的检查和诊断，以确定病因，并获得相应的治疗建议。自行用药可能加重症状或延误病情。