龟头根部出现疙瘩可能是由多种原因引起的。其中一种可能是阴茎头部的真菌感染，称为白色念珠菌病。这种感染通常导致龟头周围出现红色、疼痛和瘙痒的症状，同时伴有小颗粒状疙瘩。另一种可能性是阴茎头部的软组织增生，即珍珠状丘疹。这些丘疹是无害的，通常不会引起疼痛或其他不适，但在一些情况下可能会因摩擦而引起不适。龟头根部疙瘩还可能是由于过度清洁或使用刺激性清洁剂导致的皮肤过敏反应，或是其他皮肤疾病如湿疹或牛皮癣引起的。要确定确切的原因，建议咨询医生进行检查和诊断。