男性生殖器长疙瘩的原因有多种，以下是几种常见的情况：

1. 毛囊炎：这是由于毛囊感染或炎症引起的，通常表现为红色或白色的小疙瘩，可能伴有瘙痒或疼痛。

2. 珍珠状丘疹：这是一种正常的生理现象，多见于龟头冠状沟周围的小白色或肉色丘疹，无需治疗。

3. 疣状物：如生殖器疣，通常由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，表现为凸起的小疙瘩，可能逐渐增大或增多。

4. 囊肿：皮脂腺囊肿是皮脂腺堵塞引起的小囊肿，通常无痛，但可能变大或感染。

5. 性传播感染（STIs）：如疱疹，表现为水泡或溃疡，伴有疼痛或瘙痒，通常由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起。

6. 皮肤病：如湿疹或银屑病，也可能在生殖器部位出现疙瘩，伴有其他皮肤症状。

上述情况中，有些是无害的生理现象，而有些可能需要医疗干预。若出现伴随疼痛、瘙痒、异常分泌物或疙瘩持续存在，应及时咨询专业医生以获得正确的诊断和治疗。避免自行处理，以免加重病情或引发感染。