生殖器痒、勃起时有轻微胀痛可能是多种原因引起的。这种症状可能与生殖器感染有关，如性传播感染或真菌感染。性传播感染包括淋病、梅毒等，而真菌感染则可能是由念珠菌引起的。过度清洁、使用刺激性洗涤剂、性行为过度、过紧的内裤等因素也可能导致生殖器不适。在确定诊断和治疗方案之前，建议就医咨询，以获取专业建议和必要的检查。医生可能会建议进行病史询问、体格检查，并可能会要求进行血液、尿液或生殖器分泌物的检测。治疗方案将根据确切的诊断确定，可能包括药物治疗、生活方式调整或其他治疗方法。及时就医并按医嘱进行治疗是减轻症状、预防并发症的关键。