慢跑可能导致肌肉分解的原因主要是运动时肌肉受到的长时间持续性负荷，尤其是长时间的有氧运动会导致肌肉中储存的能量物质如糖原和脂肪被消耗殆尽，而后身体开始分解肌肉蛋白来提供能量，这是一种称为“糖原贮存耗竭”和“肌肉蛋白分解”的生理反应。长时间的慢跑也会导致身体内的应激激素水平升高，尤其是皮质醇水平增加，这会进一步促进肌肉蛋白的分解。因此，适度控制慢跑的时间和强度，保证合理的营养摄入和充足的休息，对于减少肌肉分解是十分重要的。