阴茎短小可能由多种原因造成，主要包括以下几点：

1. 遗传因素：基因在决定身体各部分发育和生长方面起着重要作用，一些遗传因素可能导致阴茎发育不足，从而使其显得较小。

2. 胎儿发育问题：胎儿期间，受到某些环境因素的影响，如胎儿睾丸激素水平低下或受到其他异常因素干扰，可能影响阴茎的正常发育。

3. 内分泌失调：身体内分泌系统异常，如睾丸激素分泌不足，可能影响阴茎的发育，导致阴茎短小。

4. 疾病影响：一些疾病，如性腺发育不全、性功能障碍等，可能导致阴茎发育异常，使其显得较小。

5. 外界环境：生活中的一些不良环境，如长期暴露在辐射或污染物中，可能对生殖系统发育产生不良影响，进而影响阴茎的大小。

阴茎短小可能是由遗传因素、胎儿发育问题、内分泌失调、疾病影响以及外界环境等多种因素共同作用造成的。