对于孕妇出现3个月的肾结石疼痛，应立即就医，由专业医生进行评估和治疗。医生可能会建议进行以下措施：

1. 药物治疗：医生可能会开具适合孕妇的止痛药或者药物来帮助排石，但需确保这些药物对胎儿无害。

2. 水分摄入增加：增加饮水量有助于促进尿液排出，有助于排出结石，但要注意不要过量饮水。

3. 饮食调整：减少摄入高盐、高蛋白和高糖的食物，增加摄入含钙食物，如牛奶、豆制品等，有助于降低结石形成风险。

4. 休息：适当休息可以减轻疼痛感，避免过度活动。

5. 考虑手术：在孕妇中，手术通常是最后的选择，但在极端情况下，可能需要手术来移除结石。

请务必在任何治疗之前咨询医生，以确保所采取的措施对母婴安全。