造成原发性巨球蛋白血症肾损害的主要原因是肾小球滤过膜的异常，导致巨球蛋白（IgA）在肾小球内沉积，激活免疫反应，引发炎症反应和组织损伤。尽管具体的病因尚不完全清楚，但可能与遗传因素、免疫系统异常、环境因素等多种因素相关。研究表明，感染、过敏反应、遗传易感性等因素可能会诱发或加重这一疾病。一些研究还发现肠道细菌感染可能与原发性巨球蛋白血症肾损害有关，但具体机制尚需进一步探究。原发性巨球蛋白血症肾损害是多因素复合作用的结果，其发病机制仍有待进一步研究和阐明。