先天性精囊囊肿通常不是由基因变异引起的。这种疾病通常是由于胚胎期间发育过程中的异常引起的，具体原因可能包括胚胎内腺体管发育不全或闭合不全，导致精囊内液体积聚形成囊肿。大多数情况下，先天性精囊囊肿是一种解剖结构异常，而非遗传性疾病。尽管有些家族可能存在多个患者，但这更可能是由于环境因素或偶发事件，而非基因突变所致。因此，先天性精囊囊肿通常不被认为是遗传性基因变异所致的疾病。