两个肾都有结石需要做微创手术的决定需要综合考虑多个因素。肾结石的大小、位置和数量是影响手术决定的重要因素。一般来说，较大或者位于肾盂或输尿管较高位置的结石更容易导致肾功能受损或者引发肾绞痛，需要考虑手术治疗。

患者的年龄、健康状况和肾功能也是决定手术方案的重要因素。对于年轻、健康且肾功能良好的患者，微创手术可以是有效的治疗选择。微创手术通过小切口或导管进入体内，将结石粉碎或取出，通常恢复快、并发症少。

患者的症状和临床表现也需要考虑。如果结石导致严重的肾绞痛、感染或者肾功能不全，那么手术可能是必要的选择。

两个肾都有结石且需要手术的患者，应该在详细的临床评估和医生的建议下作出决定。手术前需充分了解手术风险、术后恢复以及可能的并发症，以及手术后的生活方式和饮食管理。