桂附理中丸和金匮肾气丸具有不同的药性和功效。桂附理中丸主要用于治疗脾胃虚弱引起的消化不良、食欲不振等症状，而金匮肾气丸则主要用于滋补肾气、强健腰膝、益气养血。两者在药性和作用上有所区别。

根据中医药理论，同时服用不同药物可能会相互影响，因此最好在医生指导下使用。若同时服用桂附理中丸和金匮肾气丸，建议在医生的建议下，根据个体情况调整剂量和服用方法，以避免可能的药物相互作用或不良反应。最安全的做法是遵医嘱，避免自行决定同时服用不同药物。