根据目前的科学研究和专业建议，有氧运动后应该优先补充碳水化合物。碳水化合物是身体主要的能量来源，在有氧运动过程中消耗了大量的碳水化合物。恢复期间，补充碳水化合物有助于恢复肌肉和肝糖原水平，提供能量，促进身体的恢复和修复。碳水化合物的摄入可以帮助控制肌肉分解，有助于维持肌肉质量。至于蛋白质，虽然也对肌肉修复有一定作用，但在有氧运动后的恢复阶段，碳水化合物的补充更为重要。具体的补充需求仍取决于个体的身体状况、运动强度和持续时间等因素，因此建议在此问题上最好咨询专业的营养师或医生以获取个性化的建议。