男性尿道拭子检查疼痛可能受多种因素影响。尿道黏膜的敏感性高，接受外界刺激后容易引起不适感。检查过程中可能存在拭子插入不当或操作不慎，导致疼痛感。个体差异也会影响疼痛程度，某些人可能更为敏感。建议在进行检查前，医务人员应充分解释检查过程，并采取适当的措施减轻疼痛感，如使用适量润滑剂或选择较为温和的拭子材料。若疼痛感持续或过于剧烈，建议及时告知医务人员，以便调整操作方法或采取其他检查手段。