两个男人是否发生过关系，通常可以通过以下几种方式判断：

1. 身体接触：最直接的方式是是否发生了亲密的身体接触，如亲吻、抚摸等，这些行为通常是关系发生的标志。

2. 性行为：如果两个人之间发生了性行为，包括但不限于肛交、口交等，这就可以明确认为他们发生了关系。

3. 感情互动：有些情况下，双方可能没有发生肉体上的性行为，但通过长时间的亲密接触、共同生活和情感交流，也能判断是否存在特殊的关系。这种关系可能不完全符合传统的“发生性关系”的定义，但仍然属于深度的亲密关系。

判断两个人是否发生过关系，最关键的是是否涉及到肉体接触和性行为。如果仅有情感交流或亲密的互动，没有身体接触和性行为，可能还不能称为发生关系。