性关系中男生出现疼痛的原因可能有几个方面：

1. 生理原因：男性在性行为中可能会感到疼痛，最常见的是由于过度刺激或摩擦。如果润滑不足，或进入过于剧烈，可能会导致生殖器区域的不适。包皮过长或包皮过紧也会导致摩擦时不适和疼痛。

2. 健康问题：一些男性可能患有如前列腺炎、尿道炎、生殖器感染等疾病，这些健康问题会在性行为过程中引发疼痛。特别是在有炎症的情况下，性器官的敏感度增加，任何刺激都会引起不适。

3. 心理因素：性行为中的心理紧张或压力也可能导致身体不适。有些男性在性行为前可能因过度焦虑、紧张或期待过高而产生身体的紧绷感，从而导致疼痛。

4. 姿势不当：某些性姿势如果没有适当调整，可能会使某一方受到过度的压迫或拉伸，从而引发疼痛。尤其是当双方的身体接触角度不合适时，疼痛感可能加剧。

疼痛的原因可能是多方面的，建议在发生此类问题时及时咨询医生，以排除潜在的健康问题，并考虑调整性行为中的习惯或姿势。