治疗发育不正常的阴茎短小需要专业医生的评估和指导。治疗方案可能会因个体情况而异。一些可能的治疗方式包括：

1. 药物治疗：如使用人类绒毛膜促性腺激素（HCG）、生长激素或睾丸酮等激素类药物。

2. 手术矫正：对于严重病例，手术可能是必要的，如阴茎延长手术或植入阴茎假体。

3. 心理辅导：阴茎大小与自尊心和性自信密切相关，心理辅导可帮助患者应对情绪和心理压力。

4. 康复治疗：一些物理疗法，如牵拉疗法，可能有助于促进阴茎组织的生长和发育。

治疗前应咨询专业医生，根据个体情况确定最合适的治疗方案。及早就诊有助于提高治疗效果，减少潜在的并发症。