治疗男性生殖器短小的方法通常包括手术和非手术方法。手术方法包括阴茎增长手术，如阴茎延长术和阴茎增粗术。非手术方法包括使用助勃器、阴茎增大泵、药物治疗（如泌乳素释放抑制剂）、注射填充物或植入可吸收材料。值得注意的是，这些方法的有效性和安全性存在争议，并且可能存在副作用和风险。在选择治疗方案之前，建议男性与专业医生进行详细咨询，了解不同方法的利弊，以及适合自己情况的最佳选择。