肌肉有氧和无氧训练的主要区别在于能量代谢途径。有氧训练利用氧气来分解体内储存的脂肪和糖原以产生能量，持续时间较长，例如慢跑和游泳。无氧训练则主要依赖磷酸肌酸系统和乳酸系统，不需要氧气，而是直接分解糖原以产生能量，持续时间较短但强度较高，例如举重和爬山。

有氧训练有助于提高心肺功能和耐力，而无氧训练则主要用于增强肌肉力量和肌肉耐力。有氧训练通常适合长时间的持续运动，例如长跑和游泳，而无氧训练则更适合短时间内高强度的运动，例如举重和快速爬坡。

肌肉有氧和无氧训练在能量代谢途径、持续时间和主要目的上存在明显的区别。