头孢氨苄胶囊和阿莫西林都是常用的抗生素药物，但它们属于不同的类别。头孢氨苄胶囊是头孢菌素类抗生素，主要用于治疗细菌感染，如呼吸道、泌尿道、皮肤软组织等部位的感染。而阿莫西林是青霉素类抗生素，也用于治疗多种细菌感染，包括呼吸道、尿路、皮肤等感染。

选择头孢氨苄胶囊还是阿莫西林取决于感染类型、病情严重程度、患者过敏史以及耐药性等因素。医生会根据患者的具体情况和药物的适应症来做出选择。

在使用这两种药物时，应严格按照医生的建议和药品说明书的指示使用，避免自行更改剂量或停药。要注意可能的药物过敏反应和不良反应，及时就医处理。