使用制霉菌素软胶囊可能会出现一些副作用。这些副作用可能包括恶心、呕吐、腹泻、头痛、皮疹等。制霉菌素可能导致肝功能异常，包括肝酶升高和肝损伤。在极少数情况下，制霉菌素还可能引发严重的过敏反应，如荨麻疹、呼吸困难和肿胀等。因此，在使用制霉菌素软胶囊期间，应密切注意身体反应，并在出现任何不适症状时及时就医。与医生或药师沟通，了解药物的正确用法和注意事项也至关重要。