据药物说明书和研究报道，藤黄健骨丸在一些情况下可能会引起副作用。常见的副作用包括但不限于消化不良、恶心、呕吐和腹泻。在极少数情况下，可能会出现严重的过敏反应，如皮疹、荨麻疹、呼吸困难等。长期或过量使用藤黄健骨丸可能导致肝功能异常。因此，使用藤黄健骨丸时应严格按照医生或药品说明书的指示使用，并定期监测身体状况。如果出现任何不适或异常反应，应立即停止使用并就医咨询。