龟头隐隐疼痛可能由多种原因引起。可能是因为湿疹、生殖器疱疹等皮肤病变引起的炎症所致。包皮炎或包茎导致的局部湿润环境、细菌感染也可能引发疼痛。龟头过度清洁或使用刺激性化学品可能导致皮肤过敏或刺激性反应，引发疼痛感。过度性行为、摩擦力过大、性生活不卫生等因素也可能导致龟头疼痛。

要确定疼痛的原因，建议尽快就医。医生可能会进行详细的身体检查，并可能需要进行实验室检查或皮肤刮片检查来确定病因。治疗方面，针对不同原因可能采取不同措施，例如，如果是感染引起的炎症，可能需要使用抗生素治疗；如果是过敏反应，可能需要避免刺激性物质并使用抗过敏药物。

龟头隐隐疼痛的原因多种多样，需要通过专业医生的诊断来确定具体病因，并进行针对性治疗。