五子衍宗丸和复方玄驹胶囊均为中药复方药物，常用于治疗一些消化系统疾病。五子衍宗丸由五味药物组成，如五味子、黄连等，主要用于调和胃肠功能，改善消化不良、食欲不振等症状。复方玄驹胶囊则以天然植物玄参、白芍、黄连等为主要成分，具有清热解毒、抗炎、抗菌的作用，适用于治疗胃炎、肠炎等炎症性疾病。

在选择使用这两种药物时，应根据具体病情和医生建议来确定。五子衍宗丸主要通过调整胃肠功能来改善消化问题，适合于功能性消化不良的治疗；而复方玄驹胶囊则更适用于治疗由炎症引起的胃肠道问题，如胃肠炎症或感染。因此，选择药物应根据病因和病情特点进行个体化治疗，避免自行使用药物或替换药物而导致不必要的健康风险。在使用过程中，需遵循医嘱，注意可能的药物相互作用和不良反应，及时与医生沟通调整治疗方案。