黄连上清丸是一种中药复方制剂，主要成分包括黄连、黄芩、半夏等。根据文献和临床研究，黄连上清丸可能会引起一些副作用。常见的副作用包括：

1. 消化系统：可能会出现恶心、呕吐、胃部不适等消化道症状。
2. 过敏反应：个别人群可能会出现皮疹、瘙痒等过敏反应。
3. 肝肾功能：长期大剂量使用可能会对肝肾功能产生一定影响。

尽管如此，大多数情况下，黄连上清丸的副作用较轻，并且可以通过减少剂量或者暂时停药来缓解。建议在使用此药物前，特别是孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人以及有肝肾功能障碍者，在医生指导下使用，以减少不良反应的风险。

黄连上清丸作为中药复方，虽然有一些潜在的副作用，但在医生指导下正确使用，一般能够保证安全有效。