目前尚无充分的科学证据表明泮托拉唑与雷贝拉唑之间存在明显的副作用差异。这两种药物均属于质子泵抑制剂（PPI），用于治疗胃酸相关疾病，如胃溃疡和胃食管反流病。常见的副作用包括头痛、腹泻、恶心等，并且个体差异可能导致不同的反应。患者在使用这些药物时应遵循医生的建议，并密切关注可能出现的不良反应。对于哪种药物副作用更小的问题，最可靠的建议是咨询专业医生，根据患者的具体情况和病史做出个体化的治疗决定。