复方黄连素可能会引起一些副作用。根据已有的研究和临床报告，常见的副作用包括但不限于消化不良、腹泻、恶心、呕吐等。少数患者可能会出现过敏反应，如皮疹、瘙痒、荨麻疹等。长期或过量使用复方黄连素可能导致肝功能异常，如肝酶升高等。需要注意的是，个体差异存在，因此对副作用的反应可能会有所不同。在使用复方黄连素前，应遵循医生的建议，了解自身健康状况和用药情况，以减少可能的不良反应。