性生活时阴茎疼痛可能由多种原因引起，包括但不限于以下情况：

1. 过度摩擦或刺激：过度的摩擦或刺激可能导致阴茎表皮受损或炎症，从而引起疼痛感。

2. 性传播感染：性行为中未采取适当的保护措施可能导致性传播感染，如性病、尿道炎等，引起阴茎疼痛。

3. 过度使用性玩具：过度使用性玩具或使用不当可能导致阴茎组织受损或感染，进而引起疼痛。

4. 性生活姿势不当：某些性生活姿势可能增加阴茎受力，导致疼痛或不适感。

5. 性心理压力：性心理压力、焦虑或紧张可能导致性生活时阴茎疼痛。

若阴茎疼痛持续或伴有其他症状，建议及时咨询医生进行进一步评估和治疗。