生殖器短小可能由多种因素引起，包括但不限于：

1. 遗传因素：个体的遗传基因可能会影响生殖器的大小。
2. 激素水平异常：激素在发育过程中扮演着重要角色，异常的激素水平可能会导致生殖器的发育异常。
3. 发育问题：胚胎发育期间或青春期发育不完全可能导致生殖器发育不良。
4. 环境因素：生活环境、营养状况等因素可能对生殖器发育产生影响。
5. 疾病或损伤：某些疾病或损伤可能会影响生殖器的正常发育或导致器官萎缩。

需要指出的是，生殖器大小并非衡量男性健康或性能力的唯一标准，而且对生育和性功能的影响通常取决于个体的整体健康状况。若对生殖器大小感到担忧，建议咨询医疗专家以获取专业建议和治疗方案。