男性衣原体感染可能引发多种病变。常见病变包括尿道炎、前列腺炎、附睾炎等，可能导致尿道分泌物增多、尿频、尿急、尿痛等症状。部分患者可能无症状或仅轻微不适。长期慢性感染可能导致生育系统的结构和功能异常，如输精管堵塞、不育等。衣原体感染也与尿道结石形成、膀胱炎、尿道狭窄等病变相关。病变程度与感染严重程度、感染时间长短、个体免疫状况等因素相关，因此，确诊和及时治疗对于预防病变发展至严重阶段至关重要。早期诊断和治疗可有效预防并减少病变的发生和发展。