男性生殖器变小的原因可以分为生理性和病理性两类。

生理性原因包括：

1. 年龄增长：随着年龄的增长，男性的睾酮水平会逐渐下降，导致生殖器的体积缩小。
2. 体重增加：肥胖尤其是腹部脂肪堆积，会使阴茎显得较小，因为脂肪会覆盖部分阴茎根部。
3. 生活方式：吸烟、酗酒和缺乏锻炼等不健康的生活习惯可能会影响血液循环和睾酮水平，进而导致阴茎缩小。

病理性原因包括：

1. 佩罗尼氏病：这种病会导致阴茎出现纤维斑块，使阴茎在勃起时弯曲和缩短。
2. 内分泌失调：例如低睾酮症，可能导致生殖器的体积减少。
3. 药物副作用：某些药物，如抗抑郁药、抗高血压药等，可能会影响性功能并导致阴茎缩小。
4. 糖尿病：长期未控制的糖尿病会导致血管损伤和神经病变，影响阴茎的血液供应和勃起功能。

心理因素如焦虑和压力也可能通过影响性功能间接导致生殖器显得较小。总体而言，男性生殖器变小的原因多种多样，若有此类问题，建议咨询专业医生以进行准确诊断和治疗。